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Tema
    Scientific/Engineering
        Molecular Science

453 projects in result set.
Displaying 20 per page. Projects sorted by activity ranking.
 
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Última actualización: 2013-02-01 18:37
LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

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Percentil actividad: 97.23
Activity Ranking: 15,462
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Última actualización: 2009-05-11 15:59
ISPyB

高分子(タンパク質)結晶のX線実験のためのWebベースの情報管理システムです。

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Percentil actividad: 81.56
Activity Ranking: 102,787
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Última actualización: 2013-01-05 01:59
Molecular Dynamics Studio

これは分子動力学のセルを簡単に作成するため NanoEngineer 1, PACKMOL と MSI2LMP を統合するために作成されたソフトウェアの変更のコレクションです。NanoEngineer 1 は、Nanorex によって書かれたの分子の CAD ソフトウェアは、ユーザーは分子、原子力の複数のフィールドを使用して入力するユーザーのソフトウェアの変更を許可するを作成する簡単な方法を提供します。PACKMOL は、NanoEngineer 1 の初期の MD セルをこうして提供から分子テンプレートを用いた分子のランダムなコレクションを生成できます。PACKMOL への変更を MSI2LMP ソフトウェアを介して渡される原子型のデータを許可します。MSI2LMP ベース LAMMPS の入力ファイルを作成しますクラス ii 力フィールド。MSI2LMP NanoEngineer 1 で生成された数値符号化の力フィールドのデータの使用に変更されました。MMP ファイル形式は拡張し、すべての 3 つのソフトウェア アプリケーションに統合されました。

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Última actualización: 2013-05-06 17:17
picard

次世代シーケンシング形式のデータを BAM (http://samtools.sourceforge.net) の操作のツール (Java) のセット。

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Percentil actividad: 99.94
Activity Ranking: 326
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Última actualización: 2012-10-13 23:42
Molby - A Molecular Modeling Software

Molby is a software for building molecular models on the graphic screen. It works on Mac OS X and Windows. It can import and export files for other computational chemistry softwares such as GAMESS and Gaussian. It can also edit molecules by scripts running on the built-in Ruby interpreter. Official Home Page: http://molby.sourceforge.jp/index-en.html

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Percentil actividad: 0.00
Register Date: 2010-01-21 01:18
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Última actualización: 2013-05-14 00:06
SketchEl

化学構造は、様々なケムインフォマティクスアプリケーションで使用するために、ツールをスケッチ。使用するのに便利で適度に洗練された。 MDL MOLファイルの作成と編集、動画を見るときに適しています。

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Percentil actividad: 99.54
Activity Ranking: 1,240
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Última actualización: 2013-05-01 13:51
RDKit

ケモインフォマティクスと C++ と Python で書かれて機械学習ソフトウェアのコレクションです。コアのアルゴリズムとデータ構造は、C++ で書き込まれます。Python または Java ツールキットを使用するラッパーが提供されます。また、RDKit 分布には分子がリレーショナル データベースに格納され、下部構造との類似性検索経由で取得することができます PostgreSQL ベースのカートリッジが含まれています。

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Percentil actividad: 99.35
Activity Ranking: 3,607
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Última actualización: 2013-01-12 17:30
APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

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Percentil actividad: 98.84
Activity Ranking: 6,459
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Última actualización: 2012-07-09 03:37
RasMol

SourceForgeのOpenRasMolプロジェクトは、RasMol (http://rasmol.org )の付属のプロジェクトです。

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Percentil actividad: 94.30
Activity Ranking: 31,778
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Última actualización: 2013-04-18 21:36
Bowtie

ボウタイは、超高速、短いDNA配列のメモリ効率の良い短いリードアライナ次世代シーケンサーから(読み取り)。ラングミードBは、ら:引用してください。超高速、ヒトゲノムに短いDNA配列のメモリ効率の良い配置を設定します。ゲノム生物10:R25の。

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Percentil actividad: 99.96
Activity Ranking: 227
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Última actualización: 2013-05-01 17:34
FAH-Web-Monitor

宇根アプリケーションのWEBル監視デクライアントのFolding @ホームアンシュール横向きデFAHMONを注ぐ。

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Percentil actividad: 85.38
Activity Ranking: 81,501
EYPID_PROJECT

機械可読形式へのタンパク質 - タンパク質相互作用データを記述してエンコードするために論理モデル。モデルは(UMLの)経路の建物の相互作用の前後interactiongタンパク質の状態に関する情報が含まれている必要があります。

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Percentil actividad: 55.48
Activity Ranking: 115,984
DrugScreener-G

DrugScreener G のグリッド コンピューティングの仮想スクリーニング統合環境です。グリッドを有効に大規模の仮想スクリーニングにユーザーフレンドリーとグリッド コンピューティングにアクセシビリティを強調し、コンクリートのソフトウェア スイートを実装しています。

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Percentil actividad: 34.68
Activity Ranking: 364,124
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Última actualización: 2008-08-08 04:48
QRasmol

QRasMolでRasMolの再実装したものですC + +の更新cmakeのシステムを構築してください。

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Percentil actividad: 31.01
Activity Ranking: 384,586
Crystal Navigator

Webアプリケーションは、クエリビルダの方法で、検索および表示の結晶データとそのプロパティを参照する

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Percentil actividad: 46.47
Activity Ranking: 139,461
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Última actualización: 2013-05-14 15:54
gMol

gMolは、分子構造や表面のような科学的データの3次元モデルを表示、操作するために使用される対話的可視化システムです。OpenGLと、柔軟なユーザーインターフェースのウェブブラウザウィジェットが含まれます。

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Percentil actividad: 99.11
Activity Ranking: 4,936
Comparative Data Analysis Ontology

研究分析や進化解析に使用するための比較データの表現のためのオントロジーの開発。詳細については、www.evolutionaryontology.org参照してください。

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Percentil actividad: 84.36
Activity Ranking: 87,194
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Última actualización: 2008-07-28 22:50
LSG (Life Science Grid)

LSGは視覚的なデータ統合のために設計され、Microsoft .NET 2.0とCABに基づくWindowsアプリケーションフレームワークです。管理ユーティリティはLSGアプリケーション、モジュール、イベント、およびサービスを管理し、クライアントはモジュールの統合と機能フックを提供します。

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Percentil actividad: 75.14
Activity Ranking: 64,759
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Última actualización: 2008-11-21 17:30
4DiCeS

4次元セルシミュレータは(4DiCeS)でのフレームワークですハイブリッド(確率確定)のモデリングと4Dで(全体)セル環境のシミュレーション。フレームワークは、4Dのグリッドレイアウト内の任意の反応と拡散アルゴリズム適用組み込むことができる。

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Percentil actividad: 71.44
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Última actualización: 2007-12-18 21:58
Chemical laser simulator

このプログラムは、多成分拡散、非平衡化学反応や放射線が含まれて細いジェット近似のナビエストークス方程式の2次元システムを解くことによって超音波連続波化学レーザーの性能をシミュレートする

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Percentil actividad: 78.02
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